Operon LAC
El Opern lactosa, que abreviadamente se denomina Opern lac, es un
sistema inducible que est bajo control negativo, de manera que la
protena reguladora.
Genes y regiones reguladoras:
lacI: gen que codifica el represor
lacP: regin promotora del opern (no es un gen)
lacO: regin operadora del opern (no es un gen)
lacZ: codifica la -galactosidasa (EC 3.2.1.23)
lacY: codifica la permeasa de lactosa
lacA: codifica la transacetilasa de -galactsidos (EC 2.3.1.18)opern
Protenas:
CAP (catabolite gene activator protein / cAMP receptor protein, CRP):
se une a la regin promotora del DNA estimulando la transcripcin
del opern (control positivo); para unirse al DNA necesita haber
unido cAMP
Represor (o tambin protena LacI): se une a la regin operadora del
DNA e impide la transcripcin del opern (control negativo); tambin
une alolactosa o IPTG, en cuyo caso no puede unirse al DNA
RNA polimerasa: realiza la transcripcin del opern, siempre que no
resulte bloqueada por el represor; acta ms eficazmente si puede
interaccionar con CAP fijado al DNA
Cuando hay lactosa presente la clula puede convertir una pequea parte
en alolactosa. sta se une al represor, impidiendo la unin de ste al DNA.
Como resultado, deja de reprimirse la transcripcin del opern y se
pueden sintetizar las enzimas que la clula necesita para captar ms
lactosa del medio e hidrolizarla como fuente de nutrientes o energa.
Si no hay lactosa disponible, el represor est libre de alolactosa, con lo que
se une al DNA y reprime la transcripcin del opern.
Cuando hay glucosa presente se reduce la formacin de cAMP en la clula.
Sin cAMP, CAP permanece inactiva y no se une al DNA, no estimula la
transcripcin del opern.
Si no hay glucosa disponible se eleva la concentracin de cAMP, que se une
a CAP activndola y sta se une al DNA, estimulando la transcripcin del
opern (siempre y cuando la transcripcin no est bloqueada por el
represor).
expresin
baja
alta
glucosa
baja
lactosa
alta
++
+
EL OPERN TRIPTFANO
El opern triptfano (opern trp) es un sistema de tipo represible, ya que el
aminocido triptfano (Correpresor) impide la expresin de los genes necesarios
para su propia sntesis cuando hay niveles elevados de triptfano. Sin embargo,
en ausencia de triptfano o a niveles muy bajos se transcriben los genes del
opern trp. Los elementos del opern trp son en esencia semejantes a los del
opern lactosa:
Genes estructurales: existen cinco genes estructurales en el siguiente
orden trpE-trpD-trpC-trpB-trpA.
Elementos de control: promotor (P) y operador (O). El promotor y el
operador estn al lado de los genes estructurales y en el siguiente orden: P
O trpE-trpD-trpC-trpB-trpA. Curiosamente, las enzimas codificadas por
estos cinco genes estructurales actan en la ruta metablica de sntesis del
triptfano en el mismo orden en el que se encuentran los genes en el
cromosoma.
Gen regulador (trpR): codifica para la protena reguladora. Este gen se
encuentra en otra regin del cromosoma bacteriano aunque no muy lejos
del opern.
Correpresor: triptfano.
En el siguiente esquema se indican los elementos del Opern Triptfano:
Elementos del Opern Triptfano
Los genes estructurales del opern triptfano se encuentran en el mismo orden
que actan las productos codificados por ellos en la ruta biosinttica del triptfano
(ver el siguiente esquema).
Orden de los genes estructurales del opern triptfano y ruta de sntesis del triptfano
En ausencia de triptfano, o cuando hay muy poco, la protena reguladora
producto del gen trpR no es capaz de unirse al operador de forma que la ARNpolimerasa puede unirse a la regin promtora y se transcriben los genes del
opern triptfano.
Opern triptfano: en ausencia de triptfano
En presencia de triptfano, el triptfano se une a la protena reguladora o
represora cambiando su conformacin, de manera que ahora si puede unirse a la
regin operadora y como consecuencia la ARN-polimerasa no puede unirse a la
regin promotora y no se transcriben los genes estructurales del opern trp.
Opern triptfano: en presencia de triptfano
Por tanto, la diferencia esencial entre el opern lac (inducible) y el opern trp
(represible), es que en este ltimo el represor del triptfano solamente es capaz de
unirse al operador cuando previamente est unido al trp.
Al estudiar ms profundamente el opern trp se encontr que adems del
mecanismo de regulacin represor-operador exista otro mecanismo de regulacin
que se denomin regulacin por atenuacin.
EL OPERN TRIPTFANO: REGULACIN POR ATENUACIN
Cuando Yanosfky analiz mutantes que afectaban al gen trpR que codifica para la
protena represora y que continuaban produciendo ARNm del opern trp an en
presencia de triptfano, observ que la eliminacin del triptfano del medio
produca un aumento casi de 10 veces en la produccin del ARNm del opern trp,
incluso aunque el represor estuviera inactivo. Yanofsky identific la regin del ADN
responsable de este aumento en la produccin del ARNm del opern trp.
Demostr que estos mutantes tenan una delecin entre el operador y el primer
gen estructural, el gen E.
La secuencia atenuadora se encuentra en la regin lder
Secuencia de bases de la regin atenuadora y comienzo de la secuencia del
gen trpE
Yanofsky aisl el ARN-m multignico del opern trp y secuenci la regin del
extremo 5 encontrando una regin lder del 160 bases que no se traduce a
aminocidos. Esta secuencia se encuentra antes del primer triplete que se
transcribe. Cuando analiz la secuencia correspondiente en el mutante que
siempre produce niveles mximos de trp, detect una delecin de una 30 bases
que se extenda desde la posicin 130 a la 160. Yanofsky llam atenuador a la
regin del ADN inactivada por la delecin, ya que su presencia conduce
aparentemente a disminuir la tasa de transcripcin.
Yanofsky comprob utilizando mutantes trpR- que incluso en presencia de altos
niveles de trp, que deberan hacer que la regin atenuadora redujera en 10 veces
la tasa de transcripcin, se seguan transcribiendo las primeras 141 bases de la
regin lder del ARN-m del opern trp, aunque el ARN-m de longitud normal solo
apareca a un nivel 10 veces menor. De forma, en presencia de altos niveles de trp
las primeras 141 bases se transcriben al mximo, pero por el mecanismo de
atenuacin que tiene lugar en esa regin, solamente uno de cada 10 ARNm se
transcribe hasta el final. Por consiguiente, la regin atenuadora acta como una
regin terminadora de la transcripcin en presencia de triptfano, mientras que en
ausencia de triptfano el atenuador se desactiva y todas las molculas de ARNm
se completan.
La regin lder del opern triptfano se caracteriza por tener una sede de
reconocimiento para los ribosomas y los codones de 14 aminocidos, entre ellos
dos residuos de triptfano. Adems, la siguiente regin puede formar una
estructura secundaria palindrmica en forma de lazo u horquilla. Cuando los
niveles de triptfano son altos, la traduccin de la primera parte del segmento lder
del mensajero impide de alguna manera la transcripcin ms all de la estructura
secundaria. Cuando los niveles de triptfano son bajos disminuye o cesa la
traduccin del polipptido sintetizado por la secuencia lder, permitiendo que la
ARN polimerasa transcriba el opern completo. Aunque no se conoce la forma en
la que tiene lugar la terminacin anticipada, es posible que los ribosomas que
traducen la regin lder produzcan la desaparicin de la estructura secundaria de
la segunda parte de la regin lder y se produzca el reconocimiento de esta regin
por el factor de terminacin.
Estructura secundaria de la regin lder
Esquema de lo que sucede con niveles altos (b) y bajos (c)
de triptfano
La regulacin por atenuacin probablemente tiene lugar en otros operones
bacterianos relacionados con la sntesis de aminocidos, ya que en todos los
casos el segmento inicial del polipptido transrcito es rico en el aminocido que
controla dicho opern. Cuando hay poca cantidad del aminocido correspondiente
la traduccin del pptido lder se detiene en los codones correspondientes al
mismo el tiempo suficiente para que se formen las estructuras secundarias que
permiten que la ARN polimerasa pueda continuar con la transrcipcin.
Porcin que se traduce de la regin lider del opern triptfano
Porcines que se traducen de las regiones lder de los operones de
Fenilalanina (a) e Histidina (b)
INTERACCIN ENTRE OPERONES
Es obvio que en las clulas existen muchos genes que estn sometidos a
diferentes sistemas de regulacin. Si nos fijamos en dos sistemas enzimticos
cualesquiera, puede darse los siguientes casos:
Que ambos sean dependientes: de manera que la presencia de uno de
ellos sea necesaria para la presencia del otro.
Que sean excluyentes: la presencia de uno impide la presencia del otro.
Que sean alternativos: la presencia de uno no depende de la presencia del
otro.
Esta situacin puede explicarse suponiendo que los productos finales catalizados
por los diferentes enzimas acten como inductores o correpresores del otro
sistema. Por ejemplo, el producto de un enzima induce la expresin de los genes
de otro sistema enzimtico, o por el contrario, el producto de otra enzima impide la
expresin de los genes de otro sistema enzimtico.
Por consiguiente, las interacciones entre operones son algo frecuente en los seres
vivos y hacen ms complejo el entendimiento de la regulacin de la expresin
gnica.
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Microbiologa medica de Patrick Murray