QUMICA ORGNICA
Texto con aplicaciones para las ciencias de la vida
ESTEREOQUMICA
Pablo Miguel Gonzlez Judd IPN Escuela Nacional de Ciencias Biolgicas Mxico 2012
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ESTEREOQUMICA: Una vez conociendo las frmulas importa tambin la forma.
INTRODUCCIN
La estereoqumica se define como la rama de la qumica que estudia la estructura molecular en tres dimensiones. El estudio de la estereoqumica de molculas orgnicas e inorgnicas complejas, as como el anlisis del fenmeno de la estereoisomera constituyen, hoy da, herramientas de gran importancia en reas como sntesis orgnica, bioqumica, inmunologa, gentica, biologa molecular y farmacologa. Mientras que la comprensin de los conceptos de configuracin absoluta y relativa nos permitir comprender la gran diversidad de productos naturales que existen, as como las diferencias en actividad biolgica que presentan muchos de ellos. Adicionalmente se revisarn las reglas I.U.P.A.C. para la determinacin de la configuracin absoluta y relativa de dichos compuestos lo cual nos permitir nombrarlos y diferenciarlos.
1. ESTEREOISOMERA Y CLASIFICACIN DE ESTEREOISMEROS
Estereoisomera. Como se mencion en el tema de isomera de la Unidad 2, adems de la isomera se descubri el fenmeno de la estereoisomera en el cual dos o ms compuestos pueden tener la misma frmula molecular condensada y en donde sus tomos estn unidos de la misma manera y que slo difieren en la orientacin de sus grupos en el espacio tridimensional y sin embargo pueden poseer propiedades fsicas y qumicas idnticas. No obstante, tambin encontraremos estereoismeros como los descritos anteriormente, pero cuyas propiedades fsicas son muy diferentes. Por ltimo, es importante enfatizar que gracias al fenmeno de la estereoisomera existe una muy amplia variedad de monosacridos, aminocidos, y muchos productos naturales con una amplia gama de actividad biolgica. Por otro lado, el dominio de la sntesis asimtrica (Unidad 8), que constituye la capacidad de generar un estereoismeros sobre otro, ha permitido en las ltimas dcadas la sntesis de una gran variedad de medicamentos en beneficio de la medicina. En 1847 Luis Pasteur encontr que la molcula de cido tartrico poda existir como dos estereoismeros en el que uno, es la imagen especular del otro, pero que poseen propiedades fsicas y qumicas idnticas. Cmo descubri esto Pasteur? Investguelo y descubrir un ejemplo de la paciencia que puede
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QUMICA ORGNICA Texto con aplicaciones para las ciencias de la vida requerir la investigacin cientfica. Con el tiempo se descubrira que muchas molculas que presentan estereoismeros, tienen la peculiaridad de que solo uno de ellos ya sea el de la serie S o el de la serie R, tienen actividad biolgica o se encuentran de forma corriente en la naturaleza.
Fig. 1 Estereoismeros del cido lctico. Obsrvese como alrededor del carbono central (Carbono quiral) los sustituyentes cambian su orientacin en ambos enantimeros. Con el transcurso de estas investigaciones se encontr que muchos alquenos tambin pueden existir como estereoismeros y que sus formas solo difieren por la orientacin espacial de sus sustituyentes. Estos alquenos, se han diferenciado usando los prefijos Cis o Trans al inicio del nombre I.U.P.A.C., aunque actualmente ya se est reemplazando este sistema de nomenclatura por el uso de (Z) y (E) respectivamente, como Cis y Trans, letras que son las iniciales de los vocablos alemanes Zusamenn y Entgegen que significan "mismo lado" y "lados opuestos" respectivamente. Para el caso particular de estos compuestos el simple cambio de la posicin de alguno de sus substituyentes origina diferencias notables en los puntos de ebullicin y de fusin de estos pares de estereoismeros. Existen tambin otro tipo de estereoismeros Cis y Trans en algunos cicloalcanos como el cis-1,2-dibromociclobutano y el trans-1,2dibromociclobutano, en los cuales los tomos de bromo unidos a carbonos adyacentes se orientan hacia un solo lado y hacia lados diferentes como se indica en el siguiente esquema.
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Fig.
Fig. 2 Ismeros CIS y TRANS del 1,2-dibromociclobutano. En los monosacridos (azcares sencillos) existe naturalmente un enorme nmero de estereoismeros cada uno de los cuales desempea un papel especfico en los sistemas vivos. Los polipptidos pueden igualmente presentar un gran nmero de estereoismeros y que anlogamente tienen una funcin en la clula. Por otro lado, la actividad biolgica de un gran nmero de productos naturales se debe precisamente a la estereoisomera, ya que cada estereoismero presenta una actividad biolgica especfica o incluso pueden existir productos naturales inactivos para una especie pero activos para otra. Antes de estudiar con ms detalle los diferentes tipos de estereoismeros que existen ser til la comprensin de algunos conceptos importantes de estereoqumica los cuales se definen a continuacin. Centro quiral. Es un tomo con hibridacin sp3 que posee cuatro sustituyentes diferentes. La orientacin espacial de sus sustituyentes, estructura tridimensional o estereoqumica de un carbono quiral, puede darse empleando una representacin o proyeccin conocida como proyeccin de cua:
Fig. 3 Representacin esquemtica de un tomo de carbono quiral por medio de la proyeccin de cuas. Los sustituyentes enlazados al carbono quiral por medio de lneas (Y y Z) estn en el mismo plano. El sustituyente enlazado por una cua rellena (X) est delante de ese plano y el sustituyente enlazado al carbono quiral por medio de lneas (H) est detrs de ese mismo plano. Y, Z, X y H son cuatro sustituyentes cualquiera distintos entre s (Por ejemplo tomos de Cl, Br, I y un grupo CH3)
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QUMICA ORGNICA Texto con aplicaciones para las ciencias de la vida Es importante sealar que existen otros tres tipos de representaciones o proyecciones que se utilizan regularmente para dar la estereoqumica de compuestos que contienen centros quirales con el propsito de especificar el estereoismero al cual nos referimos aunque tambin existe la alternativa de especificar dicho estereoismero por medio de su configuracin absoluta contenida en su nombre completo lo cual se estudiar ms adelante en las reglas para determinar la configuracin absoluta. Algunos ejemplos de compuestos con dos o ms centros quirales y que pueden representarse mediante las cuatro representaciones o proyecciones utilizadas para dar la estereoqumica de cualquier compuesto seran los siguientes: Molcula quiral. Es aquella que no es superponible con su imagen especular. Quiralidad. Se dice que es la propiedad de la no superponibilidad con la imagen especular correspondiente. La palabra viene del griego Kiros que quiere decir manos y que prigin otras palabras de uso comn como quiromancia, que es la adivinacin por medio de la lectura de manos Puede usted superponer sus manos? Piense en objetos comunes que se puedan superponer a su imagen especular, hay alguno?
Fig. 4 Molculas quirales. (Aminocidos). As como las manos derecha e izquierdas los enantimeros de una molcula quiral no pueden superponerse aunque su composicin qumica sea la misma, pues la orientacin se sus sustituyentes alrededor de un centro quiral es inversa, as como los dedos se ordenan inversamente alrededor de las palmas de las manos.
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QUMICA ORGNICA Texto con aplicaciones para las ciencias de la vida Actividad ptica. Se dice que un compuesto pticamente activo es capaz de hacer girar el plano de la luz polarizada (Qu es la luz polarizada?, es distinta de la luz normal y en su caso cmo se genera?) y que presenta quiralidad.
Fig. 5. Actividad ptica de una molcula orgnica; el naproxeno. La luz normal vibra en todos los planos, tras ser polarizada vibra en un solo plano, al atravesar esta luz una muestra contenida en un tubo especial, cambia el plano (ngulo) sobre el que vibra, el analizador detecta este cambio en los ngulos de la luz incidente y la luz que ha pasado por la muestra, como una desviacin en grados que luego se expresa como la rotacin especfica del compuesto [] D. Definido lo anterior conviene mencionar, para evitar confusiones que existen varios tipos de estereoismeros y estos pueden clasificarse en enantimeros, diastermeros en el sentido estricto, diastermeros geomtricos y compuestos meso. 1. Enantimeros. Son aquellos compuestos especulares y que no son superponibles entre s. que son imgenes
Fig. 6 Enantimeros. Cada una de estas molculas es la imagen especular de la otra, pero no son superponibles entre s. Cuando una substancia tiene un enantimero, se dice que estas 2 substancias constituyen un par enantiomrico.
2. Diastermeros en el sentido estricto. Son aquellos compuestos que no son imgenes especulares entre s, ni son superponibles entre si y que presentan centros quirales.
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QUMICA ORGNICA Texto con aplicaciones para las ciencias de la vida 3. Diastermeros geomtricos. Son aquellos compuestos que no son imgenes especulares entre s, ni son superponibles entre s y que no presentan centros quirales. 4. Compuestos meso. Son aquellos que a pesar de contener centros quirales pueden ser superponibles entre s.
Fig. 7 Cis-1,2-dibromociclobutano El Cis-1,2-dibromociclobutano es un compuesto meso, porque se puede superponer con su imagen especular, otra forma de ver a los compuestos meso, es porque al ser atravesados por un eje de simetra este los corta en 2 secciones iguales entre s.
Cuestiones adicionales. 1.-Escriba todos los ismeros posibles de Qu tipo de isomera presentan? Estas molculas entre s. frmula C5H12
2.-Indique cuales de los siguientes compuestos presentan isomera geomtrica, escriba el ismero faltante a. 1-Iodo-2-penteno b. 2-Cloro-1-propeno c. 1-Bromo-1-buteno
Responde a las siguientes preguntas y como respuesta de cada una de ellas propn una palabra clave, que te permita condensar el concepto en cuestin 1. Qu indican las letras E y Z en el nombre de un compuesto? 2. Cul es la importancia de la isomera? 3. Cules son las propiedades claves de un compuesto quiral? 4. Qu tipo de ismeros no son imgenes especulares entre s, ni son superponibles entre s pero presentan centros quirales?
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2. CONFIGURACIN ABSOLUTA
Los investigadores Cahn, Ingold y Prelog conociendo que la orientacin espacial de los sustituyentes presentes en uno o ms centros quirales en un compuesto puede cambiar y que esto se refleja, en las proyecciones de Cua, de Newmann, de Fischer (vese luego) o de Caballete, se dieron cuenta de la necesidad de incorporar la estereoqumica al nombre I.U.P.A.C. de un compuesto con el objeto de poder referirnos a un estereoismero en particular sin la necesidad del empleo de una representacin o proyeccin. As juntos en 1956 desarrollaron un conjunto de reglas para poder determinar la estereoqumica de un compuesto anexndola al nombre del compuesto lo cual permiti identificar a un estereoismero especfico mediante su nombre sistemtico. Lo anterior adems de prctico para la literatura, la investigacin y el comercio (Imagine usted que como ingeniero tiene la necesidad de solicitar a un proveedor por correo electrnico, un estereoismero especfico, de inters en su compaa, Podra usted anexar en todos los casos el dibujo del compuesto?) resulta importante por que nos permite por tanto caracterizarla de manera ms adecuada al determinar la orientacin espacial de los sustituyentes en un centro quiral, que es lo que se denomin configuracin absoluta y que nos da inequvocamente la estereoqumica de una molcula. Entonces , las reglas de Cahn, Ingold y Prelog nos permiten determinar la configuracin absoluta de los centros quirales presentes en un compuesto y que dicha configuracin absoluta es parte del nombre [Link].C. de dicho compuesto. Para poder estudiar y comprender estas reglas analizaremos el compuesto clorobromoyodometano el cual es un halogenuro de alquilo con un solo centro quiral (Cul es la frmula de este compuesto?). 1. Colocar el tomo o grupo de menor prioridad lo ms lejos del observador. Para el caso particular del clorobromoyodometano esta regla nos pide que coloquemos el tomo de hidrgeno lo ms lejos de nosotros puesto que es el tomo de menor prioridad, es decir, es el tomo con el menor nmero atmico. Esto podemos visualizarlo mediante la proyeccin de Newmann y colocando el tomo de hidrgeno lo ms lejos de nosotros de tal forma que dicho tomo no puede ser observado con esta proyeccin, lo cual puede verse en el siguiente esquema.
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Fig. 8 Proyeccin de Newman para el clorobromoyodometano. (a un lado se da la representacin de cuas, para apreciar la disposicin real de la molcula). 2. Numerar los tres tomos o grupos restantes de acuerdo a su prioridad, empleando el nmero uno para aquel que tenga la mayor prioridad. Para el caso de nuestro compuesto, los tres tomos restantes son el yodo, el bromo y el cloro a los que asignaremos los nmeros 1,2 y 3 respectivamente dado que el primero posee la mayor prioridad, esto es, el mayor nmero atmico; mientras que asignaremos el nmero 3 al cloro por tener la menor prioridad de los tres.
Fig. 9 Proyeccin de Newman para el clorobromoyodometano tras haber asignado la prioridad para sus sustituyentes (a un lado se da la representacin de cuas, para apreciar la disposicin real de la molcula). 3. Dibujar una flecha desde el tomo o grupo de mayor prioridad hasta aquel de menor prioridad. Si la flecha va en el sentido de las manecillas del reloj la configuracin es R y si la flecha va en sentido
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QUMICA ORGNICA Texto con aplicaciones para las ciencias de la vida contrario al de las manecillas del reloj la configuracin es S. Una vez que hemos numerado los tomos procederemos a dibujar una flecha como esta regla nos lo indica y de esa forma asignaremos la configuracin R o S al centro quiral de nuestro compuesto como se indica en el siguiente esquema.
Fig.10 Configuraciones R y S para el clorobromoyodometano. 4. Si dos o ms sustituyentes del centro quiral poseen la misma prioridad, se proceder a analizar la primera esfera de sustitucin. Esta regla nos dice que si dos o ms sustituyentes poseen el mismo nmero atmico tendremos que analizar los otros tres tomos unidos a l que conforman la primera esfera de sustitucin. A continuacin se da un ejemplo en el cual se aplica esta regla.
Fig. 11 D-Gliceraldehido. La configuracin de este compuesto, est dada por el tomo de oxgeno, el carbono base de alcohol y el tomo de hidrgeno, estos tres sustituyentes constituyen la primera esfera de sustitucin y son los que asignan la configuracin absoluta de la molcula, el D-Gliceraldehido tiene por lo tanto una configuracin R.
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QUMICA ORGNICA Texto con aplicaciones para las ciencias de la vida 5. Si al aplicar la regla anterior aparecen dos o ms primeras esferas de sustitucin con la misma prioridad, se proceder a analizar la segunda esfera de sustitucin para cada caso y as sucesivamente hasta determinar el sustituyente que posea la esfera de mayor prioridad. Esta regla nos dice que si encontramos dos o ms primeras esferas de sustitucin con la misma prioridad, debemos proceder a analizar las segundas esferas con el objeto de determinar que esfera posee la mayor prioridad y as determinar que sustituyente posee la mayor prioridad ; y en caso de que encontremos dos o ms segundas esferas con la misma prioridad debemos ir a analizar las terceras esferas de sustitucin para cada caso para determinar cul de ellas tiene la mayor prioridad y as sucesivamente hasta determinar el orden de prioridad para cada sustituyente. Proponga un ejemplo de compuesto donde sea necesario aplicar esta regla.
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Fig. 12 Configuracin absoluta de los centros quirales de un polisacrido. Los polisacridos son compuestos con mltiples esferas de sustitucin.
Cuestiones adicionales 1.- Escriba los siguientes grupos en orden decreciente de prioridad:
2.- Investigue las distintas proyecciones utilizadas para representar molculas. Represente por medio de estas la molcula de trans-dicloroetano.
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QUMICA ORGNICA Texto con aplicaciones para las ciencias de la vida Conteste lo siguiente, igualmente proponga como respuesta breve a cada pregunta una palabra o frase que le permita recordar el concepto clave del tema en cuestin. 1. Cmo se indica en el nombre sistemtico la estereoqumica de un compuestos qumicos? 2. Qu se hace cuando en un centro quiral 2 o ms sustituyentes tienen la misma prioridad? 3. Pueden asignarse configuraciones absolutas a tomos de carbono con dobles enlaces, si es as que regla (s) seguira para hacerlo? 4. Si una molcula tiene ms de un centro quiral se seala en el nombre sistemtico de esta la configuracin de cada centro quiral? En caso afirmativo Cmo lo hace?
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3. CONFIGURACIN RELATIVA
Los diastermeros geomtricos pueden orientarse como Cis o Trans, lo cual tambin puede indicarse como (Z) o (E) respectivamente. Para estos estereoismeros los trminos Cis y Trans o (Z) y (E) se refieren a su configuracin relativa (no se puede hablar de una configuracin absoluta al no ser en realidad los 4 sustituyentes del tomo de carbono quiral, diferentes entre s) configuracin que se indica siempre al inicio del nombre sistemtico del compuesto. En el caso de tomos unidos a los carbonos que poseen un doble enlace (Qu estado de hibridacin presentan dichos tomos? y subsecuentemente qu geometra exponen?), se elegirn los que tengan el mayor nmero atmico como en el ejemplo anterior se eligieron los halgenos con respecto al hidrgeno. En el caso de los grupos alquilo o arilo unidos a los carbonos que tienen un doble enlace estos grupos tambin tendrn prioridad en relacin con el hidrgeno. Cuando se trata de diastermeros en el sentido estricto, es posible tambin determinar su configuracin relativa Por qu se habla de configuracin relativa y no absoluta en ente tipo de compuestos? Como se evidencia al analizar respecto a su estereoisomera estereoismeros como los que exhiben algunos monosacridos que existen como pares de diastermeros conocidos como epmeros y que solo difieren en la configuracin absoluta de un solo
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QUMICA ORGNICA Texto con aplicaciones para las ciencias de la vida centro quiral como se observa en el siguiente esquema
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Fig. 13 Epmeros Como puede observarse en este esquema, ambos epmeros guardan una relacin de imgenes no especulares y no superponibles. Se usan los nombres comunes de los compuestos. Cuando se analizen las biomolculas se ver que los monosacridos pueden adems formar diastermeros ccliclos, que se denotan como alfa y beta. Otro tipo de diastermero ms complejo an lo tenemos en algunos productos naturales como l colesterol que tiene 8 centros quirales, aunque hay molculas, por supuesto, ms complejas, an con 30 o ms centros quirales. Cabe sealar que este tipo de molculas rara vez se analizan y describen por mtodos tradicionales, sino que su anlisis suele hacerse por mtodos informticos especializados.
Fig. 14 Molcula de colesterol. Se sealan sus 8 centros quirales y la orientacin de sus sustituyentes alrededor de estos. Proponga usted la configuracin de cada uno de estos centros quirales
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QUMICA ORGNICA Texto con aplicaciones para las ciencias de la vida Cuestiones adicionales 1.-Investigue 10 molculas que tengan al menos 5 centros quirales. Discuta donde son comunes estos compuestos. Responda las siguientes preguntas y proponga el concepto clave a la que cada una hace referencia, puede necesitar consultar bibliografa adicional. Pero en las ciencias de la vida algunos de los conceptos a desarrollar tienen una importancia extraordinaria. 1. A qu se refiere la configuracin relativa de una molcula? Qu es lo que esta denota? 2. Qu tipo de molculas se analizan mediante su configuracin relativa? 3. Qu es un centro pro-quiral? 4. Describa que son los epmeros y en qu tipo de compuestos se presentan.
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