PRINCIPIOS DE
ECOLOGA MICROBIANA
NIVELES DE ORGANIZACIN DE LA BIOSFERA
ECOSISTEMAS:
Los organismos que viven en un rea
determinada mas el ambiente fsico que
interacta con esos organismos (auto
sostenible y funcional).
COMUNIDADES:
Grupo ecolgicamente integrado de especies
de animales, plantas y microorganismos que
habitan un rea dada (interacciones)
POBLACIONES:
Grupos de organismos
de la misma especie
que coexisten
en el tiempo y
espacio
INDIVIDUOS
GLOSARIO :
Hbitat: sitio donde especficamente pueden vivir ciertos organismos.
Nicho ecolgico: funcin de un organismo en un ecosistema (hbitat + funcin +
interacciones).
Guild (gremio): poblaciones de una comunidad que utilizan los mismos recursos
(ej. Sulfato-reductoras, fijadoras de N).
Fitness : alto grado de adaptacin que mejora la competitividad .
Dinmica: cambios temporales en la composicin de una comunidad.
Sucesin: sustitucin de unas poblaciones por otras ms adaptadas para ocupar un
nicho ecolgico.
Microorganismos en suelo y sistemas
acuosos
DOMINIO
virus
TAMAO
MOVILIDAD
FUENTE ENERGA
-------
0,01- 0,1
------
parsitos
bacterias
procariotas
0,5 -2.0
luz, comp. orgnicos,
comp. inorgnicos
hongos
eucariotas
2 - 200
(-)
comp. orgnicos
protozoarios
eucariotas
2 - 200
comp. orgnicos
algas
eucariotas
2 - 200
(+)
luz, comp. orgnicos
Microorganismos ms importantes por hbitat
Los microorganismos en la naturaleza
Se encuentran en todos los ambientes
Acuticos
Terrestres
Atmosfera
Factores que afectan el crecimiento y distribucin de los
microorganismos:
- factores fsicos
- disponibilidad de nutrientes
- caractersticas de los propios microorganismos
- interacciones con otros microorganismos
- interacciones con otros organismos superiores: plantas, animales
Funciones generales de los microorganismos en
el ecosistema
Transformacin de nutrientes:
Descomponen materia orgnica.
Modifican sustancias para que otros
organismos las puedan utilizar
(Biorremediacin).
Son fuente de energa y de nutrientes
para otros organismos
(Quimiohetrtrofos).
Modifican el estado de algunos
compuestos importantes que pasan
de una fase a otra (ej: gaseosa a
acuosa)
Interacciones con otros organismos:
Producen compuestos inhibidores o
promotores del crecimiento
Compiten por nutrientes
MICROORGANISMOS DEL
SUELO
Composicin fsico-qumica del suelo
Horizontes del suelo
Horizonte A:
Capa superior del suelo
La regin ms superficial y de
mayor actividad fsica qumica
y biolgica.
Contiene la mayor parte del
material orgnico del suelo, vivo o
muerto:
Grandes cantidades de partes
de plantas y hojas muertas.
Insectos y otros artrpodos
pequeos.
Lombrices de tierra.
Organismos descomponedores.
Nemtodos.
O2, N2, CO2
Desechos
orgnicos
Lluvia
O2, NH3,
CH4, H2S
Inorgnicos
granulados.
Residuos
Suelo: Horizonte A
Rocas, silicatos
orgnicos,
humus.
Agua
(inundado,
mojado).
Gases
(disueltos y
difusos).
Capa de agua
Sistemas
biolgicos
(races, insectos,
microobios).
En un gramo de suelo del horizante A
pueden haber:
2500 millones de bacterias
+
medio milln de hongos
+
50 000 algas
+
30 000 protozoos
Horizonte B:
Regin de
acumulacin
Mara Cecilia Arango Jaramillo
El horizonte B:
Contiene mucho menos
material orgnico y est
menos meteorizado que
el horizonte superior.
Hay pocos
microorganismos
Algunos materiales del horizonte A,
llegan al B por filtracin del agua a
travs del suelo:
xido de hierro.
Partculas arcillosas.
Pequeas cantidades de
material orgnico.
Horizonte B
Horizonte C:
Los microorganismos son
escasos.
Compuesto por rocas y
minerales
fragmentados y
meteorizados de los
cuales se ha formado
el suelo verdadero de
los horizontes
superiores.
Factores externos que determinan que un
microorganismo sobreviva en un ambiente.
Disponibilidad de agua
Nutrientes
Concentracin de oxgeno
pH
Temperatura
Presin osmtica (Concentracin
de sales, azcares)
Presin hidrosttica
Radiacin
Interacciones con otros organismos
Positivas: simbiosis, mutualismo,
sintrofismo, etc.
Negativas: competencia, antagonismo,
predacin, etc
Factores que
afectan el nmero y
la diversidad de
los organismos en
el suelo
3. Profundidad del perfil: determina
nutrientes (materia orgnica y O2 )
4. Contaminacin del suelo:
Txicos.
Inhibidores del crecimiento
microbiano
1. Propiedades fsicas y qumicas del suelo:
Disponibilidad de agua.
Textura,
Contenido de materia orgnica, etc.
2. Tratamiento del suelo
Labranzas: Aereacin/compactacin,
Distribucin de la materia orgnica.
Disponibilidad de agua.
Aplicacin de productos:
Naturales (abonos vegetales o animales)
Agroqumicos
Tipo y manejo de cultivo
Los microorganismos son indicadores de
calidad de
suelo y de la sustentabilidad del manejo
Nutrientes necesarios para el
crecimiento microbiano
Fuente de Energa
luz (Fottrofo)
qumica (Quimitrofo).
Fuente de Carbono
Comp. orgnicos (Organtrofo)
Comp. inorgnicos (Auttrofo).
Fuente de Nitrgeno.
Fuente de Fsforo.
Fuente de Azufre.
Elementos minerales traza.
Vitaminas.
El principal nutriente
es la fuente de energa
En organismos
quimioorgantrofos
(hetertrofos) la fuente
de energa y de carbono
son el mismo compuesto
Los microorganismos en
el suelo
Contribuyen a la formacin
de materia orgnica
la convierten en cido
carbnico o cidos
orgnicos
disuelven rocas.
Controlan la
disponibilidad de
muchos nutrientes
importantes para las
plantas
Hongos
Dominantes en la superficie de ecosistemas terrestres.
Constituyen del 70-80 % de la biomasa microbiana total del suelo, especialmente en suelos ricos
en materia orgnica, bien aireados y con pH cidos
Funcin principal: Degradadores de polmeros vegetales
(hetertrofos)
Caractersticas:
No crecen en condiciones extremas pero las toleran.
Alta capacidad de dispersin por la formacin de esporas.
Interacciones con las plantas.
Beneficio:
Capturan nutrientes y los hacen disponibles.
Pueden controlar hongos patgenos, nemtodos e insectos.
Perjuicio:
Patgenos
Bacterias
Importantes en suelo en cualquier condicin
Funciones:
- Recicladores de los principales elementos de la
naturaleza.
- Productores primarios en ambientes extremos.
Caractersticas:
Ubicuidad y diversidad metablica:
Sobreviven a escasez de nutrientes y
toleran txicos.
Tamao pequeo y generalmente
mviles
Pueden adherirse a superficies
Gran plasticidad gentica y alta
velocidad de crecimiento para
adaptarse a condiciones ambientales
adversas.
Beneficio:
Antagonistas de patgenos.
Productores de promotores del crecimiento
vegetal.
Responsables nicos de la fijacin biolgica
de nitrgeno gaseoso.
Capturan nutrientes y los hacen disponibles.
Pueden controlar hongos patgenos,
nemtodos e insectos.
Perjuicio:
Patgenos.
Protozoarios
Se desarrollan en suelos con pH neutro y elevada humedad
Funciones principales:
Predadores de bacterias, algas y otros protozoarios.
Mineralizadores.
Implicancias de la predacin de bacterias:
Recirculacin de nutrientes: relacin C:N mayor que en bacterias
No extinguen poblaciones bacterianas: crecimiento depende del
N de bacterias:
Caractersticas:
Diversidad en tamao.
Son Hetertrofos (algunos fotosintticos), la mayora requiere
oxgeno.
No sobreviven a 50 C.
Formas de resistencia (cistos) si hay escasez de nutrientes.
ROL DE LOS MICROORGANISMOS
EN EL SUELO
Mineralizacin de la materia orgnica
Descomposicin de hojas (Sucesin)
Tiempo (las fases pueden ser simultneas)
Hongos:
glucfilos
utilizacin de
las sustancias
hidrosolubles
Hongos
celulolticos:
metabolismo
de la celulosa
Hongos
lignolticos :
degradacin de
la lignina
Bacterias: transforman residuos fngicos y
productos no consumidos
por las hifas.
Mara Cecilia Arango Jaramillo
Proteccin de los microorganismos ante
desequilibrios ambientales
Cuando se aade materia orgnica a los suelos
agrcolas, las bacterias consumen todo el carbono
disponible.
Consecuencia: rarefaccin, e incluso desaparicin de
los microorganismos.
Naturaleza
Sistemas de proteccin para los microorganismos
sobrevivan
Mara Cecilia Arango Jaramillo
Estructuras de proteccin de los hongos
Clamidospora:
Clula latente, con pared gruesa
y cuyo contenido es rico en
reservas.
Clamidospora de Fusarium
Esclerote:
Esfera cuyo envoltorio externo est
constituido de hifas muertas de
pared gruesa, y el centro de
filamentos vivos ricos en
reservas, en estado latente.
Aspergillus sclerotium
Estructuras de proteccin delas bacterias
Las (Gram+) forman
endosporas.
Capaces de sobrevivir
muchos aos en condiciones
Las Gram- estn
desprovistas de mecanismos
de resistencia
Forman agregados
biolgicos cuando las
condiciones son
desfavorables
La actividad celular y las
divisiones, se hacen ms
lentas.
desfavorables.
Bacillus anthrascis
FACTORES LIMITANTES DEL
CRECIMIENTO
MICROBIANO
1. Competencia entre los microorganismos
Existe competencia
entre los
microorganismos por
utilizacin de los
nutrientes orgnicos e
inorgnicos.
En el suelo la materia
orgnica fcilmente
utilizable es reducida, lo
que limita su
velocidad de
multiplicacin.
Al aadir al suelo materiales
frescos, estircol o desechos
vegetales
el nmero de
microorganismos aumenta
rpidamente
los nutrientes se agotan
poblacin de microorganismos
vuelva nivel anterior.
Los auttrofos no compiten por nutrientes
orgnicos con otros microorganismos.
Slo compiten por luz
Nitrosomonas y Nitrosobacter
Su desarrollo est limitado por compuestos
nitrogenados apropiados.
2. Oxgeno
Mara Cecilia Arango Jaramillo
Importante:
El oxigeno es escencial
Microorganismos
fijadores
de NITRGENO
En suelos poco aireados hay
competencia por el O2 disponible.
Esto puede llevar a un descenso de
la poblacin de m.o. aerobios.
Consecuencia:
Disminuye la fijacin de nitrgeno y
degradacin de la materia orgnica.
Anaerobios
facultativos
Presencia de oxgeno:
Degradacin completa de polisacridos,
descomponindolo hasta CO2 y agua
con alta liberacin de energa
Ausencia de oxgeno:
Fermentacin: degradacin parcial de
polisacridos y poca liberacin de
energa
3. pH
4. Agua
Importante:
DISPONIBILIDAD DE AGUA
Potencial osmtico
alto
(suelos salinizados)
Agua poco asequible a los m.o.
Consecuencia:
Se inhibe el crecimiento de la
mayora de los m.o. y races.
Solo sobreviven los halfilos
Exceso de agua
(suelos inundados)
Produce prdida de oxigeno en
los capilares del suelo.
Consecuencia:
Disminuyen los microorganismos
aerobios y aumentan los
anaerobios
