UNT- 2014 III CICLO
ING. AGROINDUSTRIAL
BIOCATALISIS,PROTELISIS
E ISOENZIMAS
Alumno: Salinas Lopez Juan Irving
Docente: Gutierrez Ramos Miriam
Curso: Bioqumica General
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NDICE
Contenido Paginas
Presentacin.. 2
Introduccin 3
Captulo 1: Biocatalisis.. 4
Captulo 2: Regulacin de la actividad enzimtica. 6
Mecanismos que modifican la cantidad de enzimas ... 6
Mecanismos que modifican la actividad enzimtica ... .. 7
Enzimas alostericas.. 8
Catlisis covalente... 10
Ejemplos de catlisis covalente. 11
Captulo 3: Protelisis.. .13
Protelisis limitada 13
Proteasas o peptidasas 14
Captulo 4: Isoenzimas.. 16
Determinacin de isoenzimas..16
Referencias Bibliogrficas.18
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PRESENTACIN
Alumno de la Facultad de Ciencias Agropecuarias, escuela de ingeniera agroindustrial,
tengo el agrado de presentarle a Ud. el siguiente informe de investigacin que consta de 4
captulos; en el primer captulo se realiza una breve definicin de biocatalisis, en el
segundo captulo abunda el tema de regulacin de la actividad enzimtica sealando sus
mecanismos que modifican tanto su cantidad y actividad de enzima. Y por ltimo en el
tercer y cuarto captulo se desarroll de una forma breve y clara los temas de protelisis e
isoenzimas respectivamente.
Espero que el informe desarrollado sea de su agrado y cumpla todas sus expectativas
planteadas
Los Autores.
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INTRODUCCIN
Para el desarrollo del siguiente informe de investigacin se tendr en cuenta las
definiciones de dos temas: Enzimas y Biocatalisis.
Las enzimas se definen como biocatalizadores de naturaleza proteica que tiene como
funcin llevar a cabo la catlisis de las reacciones biolgicas. Cada clase de enzima
cataliza un tipo especfico de reaccin qumica, necesitndose una gran variedad de
biocatalizadores en el metabolismo de cualquier tipo de clula
Las enzimas se utilizan ampliamente en la industria biotecnolgica, ya que pueden
catalizar reacciones a temperatura ambiente y a presin atmosfrica, reduciendo los
costes energticos del proceso y de tratamiento de residuos, ya que de realizarse
mediante sntesis qumica, requeriran condiciones ms drsticas
Biocatlisis se puede definir como el uso de sustancias naturales para acelerar (o
catalizar) reacciones qumicas. Las sustancias naturales de las que hablo pueden ser una
o ms enzimas o clulas. Una enzima es simplemente un catalizador de protenas,
enzimas y tienen muchos usos importantes. Cada reaccin de cualquier ser vivo, incluido
usted, prosigue gracias a la presencia de enzimas. Las enzimas ayudan a digerir los
alimentos, producir alimentos vitales, mover los msculos y hacer casi todo lo dems que
se pueda imaginar. Las enzimas tambin se utilizan en su vida diaria a diario para mejorar
el rendimiento de los detergentes ("protena sale de protenas"), hacer la cerveza y el
vino, la comida de procesos, permiten a los laboratorios de diagnstico que le diga lo que
est mal con usted, y muchas otras tareas que parecen a suceder de forma automtica
todos los das.
Las reacciones qumicas que uno normalmente piensa en cmo siendo catalizada por la
enzima son los biolgicamente relacionados. Por lo tanto, la biocatlisis incluye la
conversin enzimtica de un solo paso para producir cido asprtico (un componente del
edulcorante no calrico aspartamo), la oxidacin de dos pasos de etanol a cido actico
(vinagre se puede hacer de esta manera), y el multi-paso elaboracin de cerveza (muy
probablemente el ejemplo ms antiguo de la biocatlisis, con registros histricos que
datan 6.000 aos!). Pero, biocatlisis tambin se puede utilizar para reemplazar muchos
catalizadores qumicos tradicionales, incluyendo catalizadores que son txicos o
contienen residuos qumicos que contaminan el medio ambiente. El impacto de la
biocatlisis en el futuro ser precisamente este: la creciente capacidad de utilizar enzimas
para catalizar reacciones qumicas en procesos industriales, como la produccin de
sustancias farmacolgicas, sabores, fragancias, productos qumicos, equipos de
polmeros qumicos que literalmente afectan casi todos los aspectos de su vida. Al
adoptar biocatlisis como tecnologa dominante para la produccin qumica, vamos a
introducir una tecnologa que es ms ecolgico, reduce la contaminacin y el costo, y crea
una mayor sostenibilidad. Eso s que es una buena razn para conocer!
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CAPITULO 1: BIOCATALISIS O CATLISIS ENZIMTICA
Las enzimas son protenas que catalizan las reacciones bioqumicas en los organismos
vivos con una gran especificidad. Existen alguna enzimas con especificidad absoluta, es
decir, que slo son vlidas para catalizar una determinada reaccin, como p. ej. la ureasa,
que cataliza la hidrlisis de la urea. Las hay que presentan especificidad de grupo, como
las enzimas proteolticas, que catalizan la hidrlisis de pptidos con ciertas caractersticas
estructurales. O enzimas con especificidad estereoqumica, ya que catalizan reacciones
de un estereoismero de una determinada molcula y no del otro.
Esta actividad cataltica, para la mayora de las enzimas est restringida a una zona
pequea de la molcula denominada centro activo. La molcula sobre la que acta la
enzima, denominada sustrato, se enlaza al centro activo formando un complejo enzima-
sustrato. Mientras est enlazado a la enzima, el sustrato se transforma en el producto,
momento en el que se libera de la enzima.
El caso ms simple de catlisis enzimtica es aquel en el que hay un nico sustrato. El
mecanismo sera:
donde E y S son la enzima y el sustrato, P el producto y ES el complejo de adicin
enzima-sustrato.
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En la mayora de las reacciones enzimticas la concentracin de enzima es mucho menor
que la concentracin de sustrato ([E] << [S]) por lo que [ES] es mucho ms pequea que
[S] y puede aplicarse la aproximacin del estado estacionario para ES.
En la catlisis enzimtica, tanto el pH como la temperatura tienen una gran influencia en
la velocidad de la reaccin, existiendo unos valores ptimos para los que la velocidad de
reaccin es mxima. As, las enzimas se desactivan rpidamente cuando la temperatura
aumenta por encima de los 35 C, debido a la desnaturalizacin de las protenas (prdida
de la estructura terciaria). Lo mismo ocurre cuando las disoluciones son fuertemente
cidas o bsicas.
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CAPITULO 2: REGULACIN DE LA ACTIVIDAD ENZIMTICA
La actividad de las enzimas en las clulas est sujeta a una variedad de mecanismos
reguladores. La cantidad de enzima puede alterarse si se aumenta o disminuye su
sntesis o su degradacin.
Mecanismos que modifican la cantidad de enzimas
a). Induccin enzimtica:
Se refiere al incremento de la biosntesis de la enzima
En el proceso de induccin enzimtica, el sustrato o un compuesto estructuralmente
similar al sustrato, dispara la formacin de enzima(s) qu normalmente estn relacionadas
con la degradacin del sustrato. A las enzimas as activadas se les denomina enzimas
inducibles y a la sustancia que las activa inductor. Las enzimas inducibles se sintetizan
como una respuesta a la presencia de su sustrato y, en cierto sentido, slo se producen
cuando se necesitan. De esta manera, la clula no gasta energa en la sntesis de
enzimas que no necesita.
Un caso bien conocido y estudiado es la induccin de las enzimas involucras en la
degradacin de lactosa por E. coli. Slo en la presencia de lactosa, la bacteria sintetiza
las enzimas necesarias para utilizar la lactosa como fuente de carbono y de energa para
su crecimiento. Se requieren dos enzimas para la hidrlisis de la lactosa: la lactosa
permeasa que transporta activamente el azcar al interior de la clula y la -galactosidasa
para cortar lalactosa en glucosa y galactosa.Los genes de estas enzimas forman parte
del operon de lactosa en el cromosoma bacterino.
b). Represion enzimatica:
Significa disminucin en la biosntesis de la enzima
La represin de enzimas es una forma de regulacin negativa de la transcripcin
bacteriana. En este proceso una protena reguladora provoca la represin de sntesis del
ARNm provocando una disminucin de la sntesis de enzimas.
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Aunque la inhibicin por retroalimentacin detiene la sntesis del producto final de una
ruta metablica, aun as existe un poco de prdida de energa y carbono, ya que la clula
contina fabricando enzimas las cuales no tiene que usar. En el proceso de represin
enzimatica se previene la sntesis de las enzimas relacionadas con la sntesis de ese
producto final. En el caso de la ruta de biosntesis del triptfano , el producto final
(triptfano)sirve como un efector que puede apagar la sntesis de las enzimas que estn
relacionadas con la biosntesis del triptfano. Esto produce un ahorro de muchas
molculas de ATP que deberan gastarse durante la sntesis de protenas, y conserva a
los precursores del aminocido para la sntesis de otras protenas. El proceso de
represin es ms lento que la inhibicin por retroalimentacin (qu acta
inmediatamente), ya que las enzimas pre-existentes son diluidas como resultado de la
divisin celular.
Mecanismos que modifican la actividad enzimatica
a). Modificacion alosterica:
Mecanismo por el cual una sustancia denominada efector alosterico se une a la enzima
en un lugar llamado sitio alosterico, mediante interacciones dbiles y provoca cambios
conformacionales, que modifican la velocidad de reaccin.
Ejemplo:
La isocitrato deshidrogenasa es una enzima del ciclo de Krebs que se activa por ADP. El
ADP se une a un sitio diferente del sitio activo, llamado el sitio alosterico.
La regulacin alosterica es comn, y los cambios de actividad como respuesta a los
efectores alostericos tienen sentido fisiolgicamente hablando, la cual se denomina lgica
molecular de la celula. Cuando se considera que una de las funciones primordiales del
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ciclo de Krebs es proveer de equivalentes reducidos para la biosntesis del ATP, entonces
puede racionalizarse la regulacin del ciclo de Krebs por el ADP. Cuando la concentracin
del ATP disminuye, la concentracin de ADP aumenta y sirve como seal para activar la
formacin de ATP. El ADP regula una de las primeras reacciones del ciclo de Krebs
(isocitrato deshidrogenasa) y promueve mayor actividad.
Enzimas alostericas
El termino alosterico significa otro espacio u otra estructura; las enzimas alostericas
poseen, adems del centro cataltico, el otro espacio al que se enlaza de modo
reversible y no covalente el efector o modulador.
En general el centro alosterico estn especfico para la unin del modulador, como el
centro cataltico lo es para la unin del sustrato. Algunos moduladores, como por ejemplo
la L-isoleucina para la treonin-deshidratasa son inhibidores, y por ello se les denomina
moduladores inhibidores o negativos. Otras enzimas alostericas pueden tener
moduladores positivos o estimuladores. Cuando una enzima alosterica posee solamente
un modulador especifico, se dice que es monovalente. Algunas enzimas alostericas
responden a dos o ms moduladores especficos, cada uno de ellos unidos a un centro
especfico del enzima; se dice entonces que son polivalentes. Adems un mismo enzima
alosterico puede poseer tanto moduladores positivos como negativos.
Las enzimas alostericas poseen, generalmente, pesos moleculares mucho mayores, son
ms complejos y con frecuencia ms difciles de purificar que los enzimas ordinarios,
debido a que casi todas las enzimas alostericas conocidas son oligomeros y poseen, por
tanto, tanto dos o ms subunidades constituidas por cadenas polipeptidicas, por lo
general en nmero par; hay algunas que contienen muchas cadenas. Las enzimas
alostericas muestran cierto nmero de propiedades anmalas. Algunas no son inestables
a 0 C, pero estables a temperatura ambiente o a la del cuerpo.
Las enzimas alostericas muestran dos tipos de control diferentes: heterotropico y
homotropico, segn la naturaleza de la molcula moduladora.
Enzimas heterotropicos: Son estimulados o inhibidos por la molcula de un
modulador o efector distinta de la de sus sustratos. Ejm: El sustrato de la treonin-
deshidratasa es la treonina, mientras que su modulador es la L-isoleucina.
Enzimas homotropicos: El sustrato acta tambin como modulador. Estas
enzimas homotropicos contienes dos o ms centros de unin para el sustrato; la
modulacin de estas enzimas dependen de cuantos sean los centros del sustrato
que estn ocupados. Sin embargo, una gran parte de las enzimas alostericas son
del tipo mixto homotropico-heterotropico sobre los cuales pueden actuar como
moduladores, tanto el sustrato como algn otro metabolito(o varios).
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b). Modificacin Covalente:
Es el mecanismo mediante el cual la unin por enlace covalente de un grupo qumico a la
enzima, le provoca un cambio conformacional que produce una variacin de la velocidad
de reaccin.
Los tipos mis difundidos de modificacin covalente son:
Fosforilacin desfosforilacin (P)
Adenilacin - desadenilacin (AMP grupo adenilato)
Intercambio de sulfihidrilos (SH) disulfuros (SS).
Ejemplo:
La fosforilacion de residuos especficos de serina por las proteincinasas aumenta o
disminuye la actividad cataltica, dependiendo de la enzima que se trate
Fig. Reacciones de la proteincinasa y
de la fosfatasa
El desdoblamiento proteoltico de las proenzimas (quimotripsinogeno,tripsinogeno,
proelastasa y factores de coagulacin) las convierte de formas inactivas a formas activas
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Catalisis covalente
El proceso de catlisis covalente comprende la formacin de un enlace covalente entre la
enzima y uno o ms sustratos. La enzima modificada despus se convierte en un reactivo.
La catlisis covalente introduce una nueva va de reaccin cuya energa de activacin es
ms baja y por ende, es ms rpida que la va de reaccin en solucin homognea. Sin
embargo, la modificacin qumica de la enzima es transitoria; en el momento en que se
completa la reaccin, la enzima vuelve a su estado no modificado original. De este modo,
su funcin permanece cataltica. La catlisis covalente se observa con particular
frecuencia entre enzimas que catalizan reacciones de transferencia de grupo. Los
residuos sobre la enzima que participa en la catlisis covalente por lo general son cistena
o serina y, en ocasiones, histidina. La catlisis covalente a menudo sigue un mecanismo
de ping-pong: uno en donde le primer sustrato es unido y su producto se libera del
segundo sustrato
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Ejemplos:
LA QUIMOTRIPSINA
Catlisis mediante quimotripsina.
1 El sistema de transmisin de carga elimina un proton de Ser 195, lo que la hace un
nucleofilo mas potente.
2 La Ser 195 activada ataca el enlace peptdico y forma un intermediario tetradrico
transitorio.
3 La liberacin del pptido amino terminal se facilita por donacin de un proton al grupo
amino recin formado por His 57 del sistema de trasmisin de carga, lo que da un
intermediario acilo-Ser 195.
4 His 57 y Asp 102 colaboran para activar una molecula de agua, que ataca el acilo-Ser
195, lo que forma un segundo intermediario tetradrico.
5 El sistema de transmisin de carga dona un proton a Ser 195, lo que facilita el
rompimiento de intermediario tetradrico para liberar el pptido carboxilo terminal 6
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LA FRUCTOSA -2,6- BISFOSFATASA.- enzima reguladora de la gluconeognesis
Catlisis mediante fructosa-2,6-bisfosfatasa
1) Lis 356 y Arg 257,307 y 352 estabilizan la carga negativa cudruple del sustrato
mediante interacciones entre una carga y otra. Glu 327 estabiliza la carga positiva
sobre His 392.
2) El nucleofilo His 392 ataca al grupo fosforilo C-2 y lo transfiere hacia His 258, lo que
forma un intermediario fosforilo-enzima. La fructosa -6-fosfato abandona la enzima
3) Ataque nucleofilico por una molcula de agua, posiblemente asistido por Glu 327
que acta como una base, forma fosfato inorgnico.
4) Se libera ortofosfato inorgnico a partir de Arg 257 y Arg 307.
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CAPITULO 3: PROTELISIS
Proceso de degradacin, qumica o enzimtica, de las protenas por rotura de los
enlaces peptdicos.
Proceso en el que la adicin de agua a los enlaces peptdicos de las protenas
fragmenta la molcula proteica. Este proceso puede estar catalizado por
numerosas enzimas.
La protelisis tiene varias funciones para la clula, entre ellas:
Eliminacin de metionina en el extremo N-terminal tras la traduccin.
Eliminacin de las secuencias seal de pptidos despus de su transporte a travs de
la membrana.
Separacin de protenas virales que se traducen desde un ARN mensajero
monocistrnico.
Digestin de protenas de los alimentos como fuente de aminocidos.
Conversin de protenas inactivas (proenzimas, zimgenos, pre-hormonas) en sus
formas funcionales finales.
Degradacin de ciclinas y otras protenas requeridas para la progresin en el ciclo
celular.
Protelisis limitada
Se refiere a la transformacin de la forma inactiva de una enzima, denominada
proenzima, en la forma activa o cataltica, a travs de un proceso de protelisis
parcial. Este proceso es realizado por otras enzimas denominadas proteasas, que
catalizan la ruptura de slo una o de pocas uniones peptdicas de la proenzima, lo que
produce cambios estructurales conformacionales que permiten dejar expuesto el sitio
cataltico (Fig. 1). En el interior de la clula, el mecanismo de proteolisis limitada
permite la activacin de una serie de enzimas del tipo de las quinasas, por lo que
constituye un mecanismo de regulacin de la fisiologa intracelular.
Fig. 1. Activacin de una proenzima por el mecanismo de proteolisis dirigida.
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La protelisis parcial o limitada tambin tiene importancia en el medio extracelular;
all se le asocia con cambios conformacionales de enzimas de tipo digestivo, por
ejemplo la activacin del pepsingeno a pepsina, o con la participacin en la
transformacin de protenas con una determinada conformacin, lograda por una
protelisis parcial de una protena precursora no activa. Este mecanismo est
presente en procesos tales como: cambios postraduccionales que sufren algunas
protenas de secrecin, como es el caso del colgeno; la maduracin o activacin
de algunas hormonas, la coagulacin sangunea y la inflamacin, entre otros.
Proteasas o peptidasas
Las peptidasas (antes conocidas como proteasas) son enzimas que rompen los
enlaces peptdicos de las protenas. Usan una molcula de agua para hacerlo y
por lo tanto se clasifican como hidrolasas.
Las peptidasas se encuentran naturalmente en organismos vivos, donde se usan
para la digestin molecular y la reduccin de protenas no deseadas. Las
peptidasas pueden romper ya sea enlaces peptdicos especficos (Protelisis
limitada), dependiendo en la secuencia de aminocidos de la protena, o pueden
reducir un pptido completo a aminocidos.
Clases de proteasas o peptidasas
Las ms importantes en biocatlisis son:
1. Serina proteasas
2. Aspartil proteasas
3. Metaloproteasas
4. Cistein proteasas
Las serina proteasas son las ms utilizadas, se subdividen en:
grupo A: tripsina; quimotripsina; elastasa; trombina
grupo B: subtilisina y homlogos
Los miembros de cada grupo tienen un ancestro comn,los grupos A y B se han
hecho similares a travs de un proceso de evolucin convergente
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ACCION DE SERINA PROTEASAS
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CAPITULO 4: ISOENZIMAS
Tambin llamado isozimas.Son formas de enzima distintas que catalizan la misma
reaccin
Los organismos superiores a menudo elaboran varias versiones de una enzima
dada desde el punto de vista fsico, cada una de las cuales cataliza la misma
reaccin. Al igual que los miembros de otras familias de protena, estos catalticos
de protena o isozimas surgen por medio de duplicacin de gen. Las isozimas
pueden mostrar diferencias sutiles de propiedades como sensibilidad a factores
reguladores particulares o afinidad de sustrato (ej., hexocinasa y glucocinasa) que
las adaptan a tejidos o circunstancias especficas. Algunas isozimas tambin
pueden aumentar la supervivencia al proporcionar una copia de respaldo de una
enzima esencial.
Las isoenzimas son protenas que difieren en la secuencia de aminocidos pero que
catalizan la misma reaccin, estando presentes en la misma especie. Estas enzimas
poseen diferentes propiedades fsicas y qumicas determinadas genticamente (punto
isoelctrico, especificidad de sustrato y cofactor, etc.), suelen mostrar diferentes
parmetros cinticos (i.e. diferentes valores de KM), o propiedades de regulacin
diferentes. La existencia de las isoenzimas permite el ajuste del metabolismo para
satisfacer las necesidades particulares de un determinado tejido o etapa del desarrollo.
Por ejemplo, la creatina quinasa (CK) presente en el cerebro difiere fisicoqumicamente
de sus isoenzimas especficas de msculo cardaco y esqueltico. Asimismo, las
isoenzimas pueden tener distinta localizacin subcelular como por ejemplo la glutmico
oxalactica transaminasa (GOT) presente en mitocondria difiere de la citoslica. En
cambio las diferentes isoenzimas de la lctico deshidrogenada (LDH) estn presentes
en compartimientos citoslicos.
En trminos muy generales, las diferencias en el contenido enzimtico son puramente
cuantitativas, es decir, las mismas enzimas estn presentes en su mayora en diversos
tejidos, pero sus actividades relativas muestran grandes diferencias de rgano a rgano.
Determinacin de isoenzimas:
La determinacin de la actividad de varias isoenzimas son metodolgicamente ms
costosas que las medidas de la actividad total de una enzima. Slo se emplea a algunos
casos particulares. Por ejemplo bajo la sospecha de carcinoma prosttico, resulta de
inters la determinacin de la actividad de la isoenzima de la fosfatasa cida que es
inhibible por tartrato, ya que esta isoenzima es especfica de la prstata. La determinacin
de la actividad de las isoenzimas de LDH es de gran valor diagnstico.
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ISOENZIMA
SUBUNIDADES
Tejidos en donde se
encuentra la
Isoenzima
mayoritariamente
Niveles normales
de cada isoenzima
en el adulto
LDH-1 HHHH
Miocardio, eritrocito 17-27%
LDH-2 HHHM
Miocardio,eritrocito 27-37%
LDH-3 HHMM Celulas linfoide,
Cerebro,rion
18-25%
LDH-4 HMMM
Higado,musculo
esqueletico
3-8%
LDH-5 MMMM Higado,musculo
esqueletico
< 5%
*En estos valores puede haber ciertas diferencias por la tcnica o por criterios de normalidad
propios de laboratorios concretos, a veces en el rango de valores y otras veces por las unidades a
las que se hace referencia.)
Las cinco isoenzimas de la LDH tienes el mismo peso molecular y difieren en la carga que
contienen. Esta diferencia es el principio de la determinacin diferencial, que se realiza
por separacin electrofortica. La fraccin con mayor movilidad hacia el anodo (polo
negativo) es la isoenzima de tipo LDH-1 y la de menor movilidad es la LDH-5.
Como la vida media de las LDH-1 (HHHH) (especifica de corazn) es diez mayor que la
de la LDH-5 (MMMM), especifica de musculo esqueltico, despus de un infarto de
miocardio se puede comprobar la preponderancia de la isoenzima cardioespecifica aun
cuando la actividad de LDH total retorne a los valores normales.
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REFERENCIAS BIBLIOGRFICAS
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de Harper Ilustrada 28 Edicion. Mexico: McGraw-Hill; 2011.
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3 Ed. Ediciones Omega, S.A. Reimpresion. Espaa
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Regulacion del metabolismo. Publicado el 19 de marzo del 2012. Disponible en:
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