APIIS memiliki Perjanjian dengan Denominasi Kristen berikut ini untuk melatih para Pendeta dan Pemimpin mereka.
Huria Kristen Batak Protestan (HKBP)
6.500.000 anggota gereja
Gereja Kristen Protestan Indonesia (GKPI)
200.000 anggota gereja
Gereja Kristen Protestan Simalungun (GKPS)
228.340 anggota gereja
Gereja Batak Karo Protestan (GBKP)
520.000 anggota gereja
Gereja Kristen Protestan Angkola (GKPA)
29.902 anggota gereja
Huria Kristen Indonesia (HKI)
270.000 anggota gereja
Banua Niha Keriso Protestan (BNKP Nias)
688.800 anggota gereja
Gereja Kristen Protestan Mentawai (GKPM)
38.772 anggota gereja
Gereja Orahua Niha Keriso Protestan (ONKP Nias)
62.274 anggota gereja
Angowuloa Masehi Indonesia Nias (AMIN Nias)
20.125 anggota gereja
Gereja Kristen Nias Protestan Indonesia (GKNP-I Nias)
40.362 anggota gereja
Huria Kristen Indonesia Protestan (HKIP)
31.000 anggota gereja
APIIS memiliki Perjanjian dengan Perguruan Tinggi/Sekolah Teologi berikut ini untuk membantu melatih mahasiswa mereka
Sekolah Tinggi Teologia Abdi Sabda
Siswa: 512
Sekolah Tinggi Teologi Huria Kristen Batak Protestan (STT HKBP)
Mahasiswa: 480
Sekolah Tinggi Diakones Huria Kristen Batak Protestan (STD HKBP)
Mahasiswa: 118
Sekolah Tinggi Guru Huria Huria Kristen Batak Protestan (STGH HKBP)
Siswa: 130
Sekolah Tinggi Bibelvrouw Huria Kristen Batak Protestan (STB HKBP)
Siswa: 191
Sekolah Tinggi Teologi Jemaat Kristus Indonesia (STTJKI)
Siswa: 50
APIIS memiliki Perjanjian dengan Organisasi Kristen berikut ini untuk melatih para Pendeta dan Pemimpin
Komite National Lutheran World Federation Indonesia